След края на предишния сезон, Хаус трябваше да признае, че е загубил връзка с реалността и не може повече да практикува медицина. Без други възможности, той се настани в психиатрична клиника. Сезон 6 ще проследи дългия и труден път на Хаус към възстановяване: ще успее ли да открие някаква форма на разсъдък и нормалност? Ще успее ли да стои далеч от работното място, което вероятно го доведе до психическа нестабилност, но е и единствената стабилна основа в живота му? Ще може ли Принстън-Плейнсбъро да продължи прочутия си Отдел по диагностика без него? Как ще се променят отношенията на Къди с Хаус, сега, когато въображаемата им връзка е разкрита?