През втори сезон, Мастър Чийф Джон-117 повежда екипа си от елитни спартанци срещу извънземната заплаха, известна като Ковенанта. След шокиращо събитие на пуста планета, Джон не може да се отърси от усещането, че войната му е на път да се промени и рискува всичко, за да докаже нещо, в което никой друг не вярва – че Ковенантът се готви да атакува най-голямата крепост на човечеството. С галактиката на ръба, Джон поема на пътешествие да намери ключа към спасението или унищожението на човечеството: Халото.